סדר ההתקנה של מסנני אוויר דחוס בדרך כלל עוקב אחר העיקרון של "קודם גס, עדין אחר כך", מה שמבטיח שלא ניתן להפוך את סדר המסננים. ראשית, האוויר הדחוס יעבור דרך מכשיר הסינון בשלב הראשון כדי להסיר את רוב החומרים המזיקים כמו אבק, שמן, חלודה ולחות. לאחר מכן, הוא נכנס למערכת הסינון העדין, הכוללת בדרך כלל מסנן מקדים ופילטר לאחר. מסננים מקדימים כגון מסננים ברמת P, ברמת U וברמת H מסננים בעיקר מולקולות שמן, מולקולות מים, חלקיקים מוצקים גדולים וזיהומים באוויר הדחוס, ביעילות סינון של 99.99% ודיוק סינון בין 3μ{ {10}}.1μ. לבסוף, המסנן העדין ברמת F מותקן בקצהו האחורי של מייבש הספיחה כפוסט-פילטר, עם דיוק סינון של 0.01μ, בעיקר מסנן אבק מהאוויר הדחוס במהלך הייבוש.
במהלך תהליך ההתקנה, יש לשים לב לנקודות הבאות:
חבר נכון את כניסת ויציאת האוויר בהתאם לכיוון לוגו המוצר, והבטח התקנה אנכית.
אם נפתרה בעיית הנפט והמים של צינורות מסועפים וציוד קצה, יש להתקין אותו קרוב ככל האפשר לציוד הקצה, בדרך כלל בטווח של 7.5 מטר.